Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL1Q00532 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms