Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HERVK_113P63121 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms