Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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