Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IDH3AP50213 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IDH3AP50213 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.9 ms