Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTBP49356 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms