Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NESP48681 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NESP48681 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NESP48681 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms