Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP2P42575 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASP2P42575 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP2P42575 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP2P42575 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP2P42575 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms