Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms