Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACTN2P35609 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms