Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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