Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN3P26045 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms