Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CA4P22748 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CA4P22748 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CA4P22748 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms