Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCLP18206 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCLP18206 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCLP18206 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCLP18206 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCLP18206 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCLP18206 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCLP18206 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms