Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MTHFD2P13995 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MTHFD2P13995 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MTHFD2P13995 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms