Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC175P0C221 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms