Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEFLP07196 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEFLP07196 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFLP07196 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms