Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms