Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLN8Q9UBY8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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