Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCDC88CQ9P219 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC88CQ9P219 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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