Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms