Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PECRQ9BY49 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PECRQ9BY49 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms