Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms