Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms