Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms