Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms