Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM175Q9BSA9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms