Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms