Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms