Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGLYRP3Q96LB9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGLYRP3Q96LB9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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