Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms