Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RASSF3Q86WH2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RASSF3Q86WH2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms