Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms