Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC24A5Q71RS6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC24A5Q71RS6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC24A5Q71RS6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC24A5Q71RS6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms