Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms