Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms