Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2BE-202ENST00000634910 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS3-201ENST00000291532 3193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LINC01159-201ENST00000433433 3103 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SERINC4-201ENST00000299969 2318 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LINC01583-202ENST00000558082 2568 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms