Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KLHL12Q53G59 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms