Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP13-3Q3SY46 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms