Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms