Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms