Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNGA3Q16281 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNGA3Q16281 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNGA3Q16281 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNGA3Q16281 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNGA3Q16281 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNGA3Q16281 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNGA3Q16281 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CNGA3Q16281 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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