Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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