Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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