Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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