Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms