Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TAF13Q15543 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms