Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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