Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAPQ14761 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms