Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PKP1Q13835 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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PKP1Q13835 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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PKP1Q13835 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PKP1Q13835 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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