Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf61Q13536 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C1orf61Q13536 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms